Duas coisas separadas controlam isso, e elas falham de maneiras diferentes.
O fluxo de trabalho. Um pedido pertence a um fluxo de trabalho. Um parceiro só vê pedidos nos fluxos de trabalho para os quais está configurado. Se um transitário tem acesso a um fluxo de trabalho e o pedido está em outro, o pedido não aparecerá de forma alguma no Action Center dele, mesmo que todo o resto esteja correto.
O registro do parceiro. O parceiro no pedido precisa ser a mesma entidade que tem usuários. Adicionar um parceiro com uma abreviatura ou um nome parecido, mas diferente, cria uma entidade separada, e os usuários da entidade real não veem nada.
O que fazer: verifique em qual fluxo de trabalho o pedido está e confira se o parceiro indicado no pedido é a entidade na qual seus contatos realmente fazem login. Se um transitário dever ver mais de um fluxo de trabalho, isso pode ser providenciado.
Exemplo
Um transitário tem acesso a um fluxo de trabalho, mas o pedido está em outro, então ele nunca aparece no Action Center dele. Separadamente, o pedido lista um parceiro com uma abreviatura, criando uma entidade separada daquela na qual os usuários do transitário fazem login, então esses usuários não veem nada. Verificar o fluxo de trabalho e a entidade exata do parceiro resolve o problema.